Kabinet Andreje Babiše čelí kritice kvůli zákonům, které by údajně mohly přinést výhody premiérovým obchodním zájmům. Některé z legislativních návrhů, jako je například zákon o předkupním právu na zemědělskou půdu, vzbuzují obavy ohledně střetu zájmů a zvýhodňování velkých společností spojených s Babišem, včetně Agrofertu. Tento zákon, pokud bude schválen, by mohl omezit vlastníky v nakládání s půdou a posílit pozici velkých pachtýřů, jako je právě Agrofert, který má významný podíl na trhu.
Další potenciálně kontroverzní návrh úpravy se týká daňových úlev pro zdravotnické preventivní programy, což by mohlo zvýšit zisky společností v rámci SynBiol, které jsou rovněž spojeny s Babišem. Tento krok je kritizován zástupci menších farmářů jako nespravedlivý, zvláště když vláda přijala opatření, která zvýhodňují velké holdingy na úkor menších zemědělských podniků.
Evropské i české úřady sledují situaci s obavami, vzhledem k možnému střetu zájmů premiéra, který i přes oddělení svých firem do svěřenského fondu, podle některých stále nevyhovuje zákonným normám. Evropská unie už zavedla vyšetřování ohledně dotací vyplácených koncernu Agrofert.
Na konci ledna Babišova vláda rozhodla zvýšit finance do zemědělských dotačních programů. Zmíněné finance dosahují 800 milionů korun, což je o mnoho více než původně plánoval předchozí kabinet. Zároveň byl obnoven dotační program na podporu zpracování zemědělských produktů, kam bylo alokováno čtvrt miliardy korun. Tento program by mimo jiné mohl napomoci několika výrobcům, které jsou součástí Agrofertu, jako jsou mlékárny Olma nebo Kostelecké uzeniny.
Kritici tvrdí, že politika Babišovy vlády zvyšuje riziko nespravedlivé hospodářské soutěže a nepřehlédnutelného propojení mezi podnikáním a politikou. Důsledky této legislativy by mohly mít dlouhodobé dopady na český trh a je nepravděpodobné, že debata kolem ní utichne v brzké době.

